Данный проект разрабатывается параллельно с проектом хозяйственно-питьевого водоснабжения, являясь при этом его составной частью. В случае с работающими водопроводами, у которых отсутствуют зоны санитарной охраны, разработка проекта СЗО для них производится отдельно.
Организация зон санитарной охраны производится для предотвращения загрязнения источников водоснабжения и систем водопроводов, так же как и мест их расположения.